Para alterar o Estoque de um produto ou Matéria Prima, você precisa fazer o seguinte procedimento:
Considerando que você já esteja na tela de edição do produto (para saber como editar um produto clique aqui), clique na aba [Estoque] da tela de edição de produtos.
Clique no botão [Ajuste].
Selecione uma das opções conforme a necessidade [Entrada] para adicionar e [Saída] para diminuir itens do estoque atual.
Digite a quantidade
Clique em salvar estoque.
Pronto, o estoque será ajustado no sistema.
OBS: essa opção serve apenas para ajuste manuais no sistema.